Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TLR1Q15399 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms