Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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