Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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SHROOM2Q13796 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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SHROOM2Q13796 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SHROOM2Q13796 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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