Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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