Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms