Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IKZF1Q13422 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IKZF1Q13422 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms