Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDM2Q13029 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDM2Q13029 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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