Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK2Q13002 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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