Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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BNIP1Q12981 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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BNIP1Q12981 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BNIP1Q12981 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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