Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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BPTFQ12830 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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BPTFQ12830 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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