Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCBP1Q09161 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NCBP1Q09161 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms