Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms