Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREMQ03060 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREMQ03060 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREMQ03060 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREMQ03060 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CREMQ03060 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms