Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2BQ00403 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms