Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERFP50548 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERFP50548 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERFP50548 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERFP50548 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms