Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMPOP42166 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMPOP42166 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMPOP42166 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms