Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF2P35227 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms