Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR1P25024 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms