Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA1P14867 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms