Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms