Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLA1P09884 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLA1P09884 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
POLA1P09884 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLA1P09884 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLA1P09884 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLA1P09884 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms