Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGKV3-11P04433 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms