Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms