Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYTIPO60759 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CYTIPO60759 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CYTIPO60759 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CYTIPO60759 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYTIPO60759 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CYTIPO60759 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CYTIPO60759 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CYTIPO60759 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CYTIPO60759 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CYTIPO60759 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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CYTIPO60759 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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CYTIPO60759 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYTIPO60759 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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