Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF14O43557 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms