Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGSM2O43147 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms