Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DGG1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DGG1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms