Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms