Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms