Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms