Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VPS4AQ9UN37 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms