Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLEC4AQ9UMR7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms