Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLEC4EQ9ULY5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms