Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DBF4Q9UBU7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms