Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLKQ9UBT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms