Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LHX3Q9UBR4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LHX3Q9UBR4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms