Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK3Q9UBP4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK3Q9UBP4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms