Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP35Q9P2H5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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