Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms