Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDL2Q9NX52 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms