Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT82Q9NSB4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms