Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRDM9Q9NQV7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRDM9Q9NQV7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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