Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PLVAPQ9BX97 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms