Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR3CQ9BUI4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms