Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPA33Q99795 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms