Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSPAN18Q96SJ8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms