Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNFT2Q96EX2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms