Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGF29Q96ES7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SGF29Q96ES7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms