Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PHF3Q92576 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms