Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CATSPER4Q7RTX7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CATSPER4Q7RTX7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms